月后，当噶尔丹回到科布多时，又遭到重大打击，先回到科布多的策妄阿拉布坦不但将财物、牛羊抢掠一空，还将他的妻子阿奴等人全部俘虏带走。
望着被抢劫一空的科布多，噶尔丹惊怒交加，此时他的身边只有二百怯薛，可谓到了山穷水尽。
不过，噶尔丹表现出他的坚强，并没有被了策妄阿拉布坦的叛乱击倒，迅速与西藏的第巴桑杰嘉措、青海的博硕克图济农等台吉联系，得到了一部份粮食和牲畜接济。
虽然噶尔丹恨不得立即砍下策妄阿拉布坦的脑袋，只是他还是咬牙低头，通过第巴桑杰嘉措、博硕克图济农等人的调解，以允许策妄阿拉布坦半独立的形式，让策妄阿拉布坦将妻子阿奴和一部份财物归还。
对于策妄阿拉布坦，噶尔丹并不担心，只要他稳定下来，擒杀策妄阿拉布坦易如反掌，唯一让他担心的就是明军的进攻。
取得对噶尔丹的大胜后，明军开始了对漠北之地的进攻，仅用了一个月的时间，明军已经将阿尔泰、乌里雅苏台等地收入囊中，如果不是因为天气转寒，科布多也将不存。
等到明年开春，明军肯定会恢复攻势，让噶尔丹懊恼的是，前面作战失败后，他随军用来运送军粮的数万匹骆驼落入明军手中，有了这些骆驼，明军补给能力大增，若是放任明军进攻，明年即使逃到天山脚下也不一定安全。
弘光二十年十一月，噶尔丹不顾天气寒冷，派出一支数十人的队伍赶往乌尔格城，向明军请降。
对于噶尔丹的请降，杜小山不敢擅专，派人将这支请降队伍护送往南京后，继续对漠北蒙古进攻。
等这支队伍到达南京时，已是弘光二十一年的正月了，接
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