代理大臣，照顾好母亲的日常生活，同时也从丰臣幕府每年的收入中拿出一万石来做为母亲每年的生活费，因为徳川幕府灭亡之后，徳川千姬每年从徳川幕府那里取得的每年一万石的生活费也没有了，丰臣熏自然要从丰臣幕府的收入中拔出母亲的生活费。
德川千姬对生活费到没有拒绝，只是没有要那么多，只留下了六百石，毕竟她一个人的生活，有这么多就足够了，这也差不多是一个中层武士的收入了。
而在公事方面，商毅也要向日本天皇绍仁，以及其他的大名告辞，但就在这个时候，却从皇宫里传来消息，绍仁病倒了。
原来绍仁本来就是一个性格比较强硬的人，而被迫和中国签定了不平等条约，又眼看着中国通过分封大名的方式，逐渐控了日本的大局，但中国是一个比徳川幕府更为强大的存在，绍仁心里也有一种很深的无力戚，因此绍仁越想心里越窝火，结果一下子就病倒了。
因此商毅在离开日本的时候，又亲自进了一趟皇宫，探望绍仁的病情，当然见到了绍仁上后，商毅也显得十分关心，同时又让自己随行的御医为绍仁进行诊脉。
把脉之后，御医说绍仁的病是由干憔虑过度，肝火过旺所引起来的，只平心静气，安心静养一段时间，也就没有事了，因此商毅也再三咛嘱绍仁，一定要好好的养病，等病好之后，还想邀请绍仁去中国进行访问，为中日两国的友谊再做出贡献来。
结果在商毅离开皇宫之后，绍仁的病又加重了，当天夜晚就吐了血，而在第二天只能请太上皇政仁太替他出面，给商毅等人送行，而且从此以前，绍仁就一直病势缠身，时好时坏，拖了二年时间，终于一病不起，在1654
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