兽性本能，基因重新占据了上风。
代表着混乱和无序的黑雾大蛇到处游荡，对这片大地造成了巨大的破坏。
而这时，战争与沙漠之神赛特因为某些不满哥哥丰饶之神奥西里斯的统治，正在一心筹划着谋杀自己的哥哥，无心搭理其他的事务。
于是混沌大蛇的力量污染了他和死者守护神奈芙蒂斯的孩子，使索顿基因失控变成了一个鳄鱼模样的怪物。
同时这个怪物也污染了欧西里斯和赛特妻子奈芙蒂斯的私生子，使得阿努比斯变成了一个狗头人身的怪物。
这时，赛特和丰饶之神才发现了这条恐怖的混沌大蛇对世界造成的破坏。
他们俩联合众神打败了初生的混沌大蛇，唤醒了太阳神拉，开始恢复满目疮痍的大地。
代表着基因原初欲望的大蛇被赶到宇宙黑暗区后不知道经历了什么，变得更加强大，没过多久就卷土重来，开始侵蚀拉创造的这片世界。
拉也不得不拖着没有完全恢复的身体展开与它的斗争。
这条令人恐惧的大蛇最终被众神称之为阿佩普，也叫魔龙阿波菲斯。
同时被污染的阿努比斯和索顿也变成了如同野兽一样的怪物，而众神却对他们的症状束手无策，只能让他们沉睡，将他们封印起来。