夺门有功，权势很大，石彪趁机诬陷年富，导致年富被关入诏狱，没过多久，石彪升任都督同知，并以游击将军之职率军到大同防守，率领参将张鹏等在磨儿山设岗放哨。后千余蒙古军队前来侵袭，石彪率领壮士冲入蒙古军阵中搏杀，斩杀了把秃王，拔取了蒙古军的旗帜，俘获并斩杀了一百二十人，追击蒙古军到三山墩，又斩杀了七十二人，因此功封为定远伯，依旧担任游击将军。在威宁海尚为成为晚明时期“三大虏巢”之时，石彪镇大同，请置城于威宁海，不果。朝廷命其跟随偕高阳伯李文，前往延绥镇防御蒙古军，后又急召他归还，不久充任总兵官。
两万鞑靼骑兵劫掠安边堡，石彪和彰武伯杨信等反击，连战连胜，斩杀了鬼力赤，追击鞑靼军队六十余里，生擒四十余人，斩杀五百多人，俘获两万多头马、驼、牛、羊，立下首功，因此进爵为定远侯。石彪欲图镇守大同，让千户杨斌等奏保，英宗觉得其中有诈，怀疑石彪欲图联合石亨谋反，于是将杨斌等逮捕，拷问后获知实情，下诏将石彪关入诏狱，命人审讯石彪，审出石彪私有绣蟒龙衣、拥有违反礼法的寝床等违反国法之事，坐实谋反之罪，于是英宗下令抄没石彪的家，石彪被斩杀。
石彪出任游击将军，驻守威远卫，多次领军迎战蒙古军队，每战每胜，勇冠三军，率军抗击蒙古军队，亲自入阵搏杀，斩杀了蒙古把秃王。石彪率军于安边堡再次抗击蒙古军队，斩杀鬼力赤，追击鞑靼军队六十余里，俘获两万多头马、驼、牛、羊，立下了西北第一战功，为明朝西北边境的稳定作出了贡献。