法事，其人骨鲠可用”，于是急派使者去赦免道同，可惜还是晚了一步，赦免使者到达的时候，道同已被处死。道同不畏权贵，维护一方平安，造福百姓，深得民心，死讯传出后，番禺百姓伤心欲绝，很多人将道同的排位供奉在家中祭祀，而恶霸豪强们则推杯换盏大肆庆祝。得悉道同已死的朱元璋怒不可遏，急召朱亮祖进京，并且派人逮捕其长子朱暹，押送京城。
朱亮祖触犯了多项禁令，自知犯了重罪，来到午门外，就跪下膝行前进，并一路叩头，祈求皇帝可以饶自己一命，但怒火中烧的朱元璋，根本不给其辩解的几乎，命令武士鞭打，有资料称，朱元璋亲自鞭打了数十下，然后换武士继续，朱亮祖就这样被活活打死，朱暹也被当场打死，后被剥皮，悬挂于闹市，以儆效尤，闽剧《洪武鞭侯》就来源于此，与朱亮祖勾结的恶霸们，也全被处死。
朱元璋感念朱亮祖战功，亲自为其写墓志，以侯礼下葬，洪武二十三年，已死去几年的朱亮祖被认定为胡惟庸逆党，次子朱昱连坐被处死。