独立团，在建制上划归皖江军分区指挥。三支队挺进团也做好了准备，随时在必要的时候，渡江南下与独立一团汇合。至于皖南冲出来的老三团，则因为损失过大，暂时留在皖江地区休整、补充。
至于活动在苏中的一师，以及留在苏南坚持的第六师，相隔只不过一条长江的这两个师。杨震建议虽然对外编成两个师，但对内最好还是实行一元化指挥。以便苏中、苏南部队，在作战的时候可以相互的策应。
除了部队变化相当的大之外，整个新四军的统帅机关也做了一定的改变。军长与苏北总指挥分别担任正副总指挥，原中原局第一书记则担任新四军政委，政治部主任、参谋长不变还是由原政治部主任和参谋长担任。
而原本准备随杨震调往东北任东北军区参谋长的原副参谋长，经过慎重的考虑，杨震还是建议在新四军高级指挥人员并不充裕的情况之下，在与新的正副总指挥研究后，上报中央并经过中央的批准，还是继续留在新四军工作。
改编命令的下达，新的政委到任，也就意味着杨震这个临时的政委已经完成了历史使命。就在新的整编命令下达的当天下午，在盐城临时机场上，杨震悄无声息的乘坐两架由延安飞抵盐城，为新四军补充药品、弹药以及装备的抗联运输机离开了苏北。
除了叶超与李慧兰，还有从新四军调回延安十余名新四军回学习的干部，以及自己来的时候带的贴身警卫班之外。杨震走的时候，什么都没有带走。他走的是如此的悄无声息，没有与任何人告别。甚至连庆功兼整编大会都没有参加。
北上抵达苏北的皖南部队干部，直到杨震走的第三天，才知道他们的新调来两个多月的政委已
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