叶腊石、云母、滑石、页岩及部分金属矿物、玉类化石等。
书中记载的石头产地范围广达当时的82个州、府、军、县和地区。
云林石谱的科学价值，突出地表现在它对矿物、岩石的性状描述上。
如对菩萨石的光学性质的描述是“其色莹洁”，“映日射之，有五色圆光”，“或大如枣栗，则光彩微茫，间有小如樱珠，五色粲然可喜”。
菩萨石即水晶，为透明的石英晶体。当阳光通过晶体时，会发生色散，形成“五色圆光”。
杜绾对石头颜色的描述很多，有白色、青色、灰色、黑色、紫色、碧色、褐色、黄色、绿色等。
此外，还有颜色深浅的区别，如深绿、浅绿、青绿、微紫、稍黑、微青、微灰黑等。
他还看到了石头经过风化之后会产生颜色变化，刚出土的灵壁石色青淡，“若露处日久，色即转白”。
杜绾对石头的声音很注意，常用东西敲击石头，结果有的“铿然有声”，有的“有声”，有的“微有声”，有的“声清越”，有的“无声”。
经本文作者统计，书中所记石灰岩大部分扣之有声，而且有的声音清越。
软的页岩音声低或无声，硬的页岩声音高。
叶腊石、滑石、水晶之类基本上没有石灰岩那种声音。
杜绾对于石头的坚硬程度，编辑描述相当精细。
他用甚软、稍软、稍坚、不甚坚、坚、颇坚、甚坚、不容斧凿8个等级区别石头硬度。
在800多年前能够如此精细，无疑是科学的。
杜绾还注意到了石头表面的粗细程度，分为11个级别：粗
第一百零五集 石都偶遇(3/4)