兵足饷方略，部议从之。”
誓师渡海出击
天启四年（1624年）正月初二日(公历2月8日)正式誓师，南居益亲自浮海至金门，下令渡海出击澎湖。
总兵俞咨皋、守备王梦熊统率战船40多艘、兵卒2000人，以迅雷不及掩耳之势直逼澎湖，经由列岛北部的吉贝屿，一举拿下澎湖要冲镇海港，边筑城边战斗。荷军突遭猛击，由妈宫屿仓皇退到西南部的风柜尾屿，企图死守。
明·《熹宗实录》载：“天启四年正月初二日，繇吉贝突入镇海港，且击且筑，垒一石城为营。屡出奋攻，各有斩获，夷退守风柜一城。”
清·光绪《澎湖厅志·卷11》亦载：“（天启四年）正月，遣将先城镇海港，且筑且战。番人退守风匮城。”
风柜尾屿三面环海，陆上则与莳上屿一线可通，荷军于此屿掘沟列舰，严加防守。俞咨皋夺取妈宫屿后，继续攻击风柜尾屿。然风柜尾荷军炮台坚固如铁，久攻不下。
第二次增兵
俞咨皋向南居益建议，应另以明军兵船攻击荷船，取得海上优势，大军方可登陆。南居益见大明海上军力不若荷兰人，将打败荷兰人的重责大任寄托在郑芝龙身上，于是招安郑芝龙等，授以官职，命其牽制荷舰。
南居益请调精兵增援，并亲临海上督师。先行攻击敌舰，以战船、火船、舢板等将荷军巨舰团团包围，荷舰被击沉、击伤，逃上风柜尾，龟缩于炮台中，负隅顽抗。明船一接近白沙湾，荷兰军舰便施以炮击，若离开，荷舰则不予追击，俞咨皋无计可施。
《明·熹宗实录》载：“是月，南院发二次策应舟师，委加衔都司顾
六十、俞大猷之子俞咨皋(4/12)